MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_009484	TCA	2	6	177004	177009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259174
4503	NC_009484	CAG	2	6	177030	177035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259174
4504	NC_009484	GCT	2	6	177083	177088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259174
4505	NC_009484	CTG	2	6	177092	177097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259174
4506	NC_009484	CGC	2	6	177116	177121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259174
4507	NC_009484	TCC	2	6	177153	177158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259174
4508	NC_009484	GCG	2	6	177169	177174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259174
4509	NC_009484	CGA	2	6	177233	177238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259174
4510	NC_009484	CCA	2	6	177256	177261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259174
4511	NC_009484	GCC	2	6	177300	177305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259174
4512	NC_009484	CG	3	6	177327	177332	0 %	0 %	50 %	50 %	148259174
4513	NC_009484	CCG	2	6	177349	177354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259174
4514	NC_009484	GCG	2	6	177396	177401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259174
4515	NC_009484	GAG	2	6	177484	177489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_009484	CGC	2	6	177628	177633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259175
4517	NC_009484	CGC	2	6	177638	177643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259175
4518	NC_009484	GC	3	6	177701	177706	0 %	0 %	50 %	50 %	148259175
4519	NC_009484	AAC	2	6	177750	177755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259175
4520	NC_009484	TCC	2	6	177767	177772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259175
4521	NC_009484	GCG	2	6	177794	177799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259175
4522	NC_009484	ACG	2	6	177885	177890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259175
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4524	NC_009484	TCG	2	6	177945	177950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259175
4525	NC_009484	AAG	2	6	177956	177961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259175
4526	NC_009484	CCGCT	2	10	177971	177980	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4527	NC_009484	CGC	2	6	178013	178018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259176
4528	NC_009484	CGT	2	6	178079	178084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259176
4529	NC_009484	CAA	2	6	178256	178261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259176
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4533	NC_009484	TAC	2	6	178344	178349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259176
4534	NC_009484	CGC	2	6	178433	178438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259176
4535	NC_009484	GCT	2	6	178448	178453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259176
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4541	NC_009484	TCGA	2	8	178557	178564	25 %	25 %	25 %	25 %	148259176
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4552	NC_009484	CCG	2	6	179022	179027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259176
4553	NC_009484	GCT	2	6	179060	179065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259176
4554	NC_009484	TCG	2	6	179068	179073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259176
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4561	NC_009484	ATC	2	6	179523	179528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259176
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4564	NC_009484	TCG	2	6	179611	179616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259176
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4596	NC_009484	CCGTC	2	10	180978	180987	0 %	20 %	20 %	60 %	148259177
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4601	NC_009484	ACA	2	6	181204	181209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259178
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4603	NC_009484	CG	3	6	181240	181245	0 %	0 %	50 %	50 %	148259178
4604	NC_009484	CTT	2	6	181341	181346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259178
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4619	NC_009484	TGT	2	6	181916	181921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_009484	TCA	2	6	181948	181953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_009484	CTTCG	2	10	181972	181981	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4622	NC_009484	CG	3	6	182081	182086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_009484	CAA	2	6	182129	182134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_009484	T	9	9	182165	182173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_009484	GTC	2	6	182176	182181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_009484	GC	4	8	182245	182252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_009484	GCCG	2	8	182352	182359	0 %	0 %	50 %	50 %	148259179
4628	NC_009484	ATCGC	2	10	182386	182395	20 %	20 %	20 %	40 %	148259179
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4652	NC_009484	GC	3	6	183284	183289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4653	NC_009484	GC	3	6	183307	183312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4654	NC_009484	ATC	2	6	183316	183321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4656	NC_009484	CGA	2	6	183445	183450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259181
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4736	NC_009484	GTCCTC	2	12	185847	185858	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148259183
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4742	NC_009484	CG	3	6	185946	185951	0 %	0 %	50 %	50 %	148259183
4743	NC_009484	GATGGC	2	12	185970	185981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148259183
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4745	NC_009484	CGC	2	6	186014	186019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
4746	NC_009484	CGA	2	6	186038	186043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259183
4747	NC_009484	CCA	2	6	186055	186060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259183
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4749	NC_009484	GCC	2	6	186075	186080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
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4753	NC_009484	CGCC	2	8	186215	186222	0 %	0 %	25 %	75 %	148259183
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4778	NC_009484	CGA	3	9	187291	187299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259184
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4782	NC_009484	CG	3	6	187530	187535	0 %	0 %	50 %	50 %	148259184
4783	NC_009484	CGGC	2	8	187537	187544	0 %	0 %	50 %	50 %	148259184
4784	NC_009484	ACC	2	6	187580	187585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259184
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4787	NC_009484	GA	3	6	187642	187647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4788	NC_009484	TCG	2	6	187667	187672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4809	NC_009484	GCA	2	6	188409	188414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259185
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4811	NC_009484	CTCGGC	2	12	188528	188539	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259185
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4817	NC_009484	CGT	2	6	188803	188808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259185
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4833	NC_009484	CGG	2	6	189780	189785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259186
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4854	NC_009484	ACTTC	2	10	190566	190575	20 %	40 %	0 %	40 %	148259186
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4861	NC_009484	TGGTC	2	10	190785	190794	0 %	40 %	40 %	20 %	148259186
4862	NC_009484	CGAC	2	8	190844	190851	25 %	0 %	25 %	50 %	148259186
4863	NC_009484	ACGGT	2	10	190865	190874	20 %	20 %	40 %	20 %	148259186
4864	NC_009484	GC	3	6	190949	190954	0 %	0 %	50 %	50 %	148259186
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4983	NC_009484	GGACG	2	10	195529	195538	20 %	0 %	60 %	20 %	148259189
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4985	NC_009484	GCA	2	6	195583	195588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259189
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4990	NC_009484	CGA	2	6	195772	195777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259189
4991	NC_009484	TGC	2	6	195798	195803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259189
4992	NC_009484	GCC	2	6	195892	195897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259189
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